Visoko zmogljiva tekočinska kromatografija (HPLC)

Čeprav je dvodimenzionalna gelna elektroforeza (2-DE) pogosto uporabljena metoda za analizo celotnega proteoma, ima omejitve, kot so omejena sposobnost ločevanja, diskriminatorni učinek in zapleteni operativni postopki. Pogosto je težko dobiti zadovoljive rezultate za analizo velikega dinamičnega razpona, majhne številčnosti in hidrofobnih beljakovin. Chong in sod. uporabil HPLC / masno spektrometrijo za primerjavo in analizo diferencialne ekspresije predmalignih in rakavih beljakovin. Beljakovine smo ločili s HPLC in zbrane frakcije identificirali z MALDI-TOF-MS, tako da smo beljakovine kvantitativno analizirali v diferencialni ekspresiji obeh vrst celic. Kot nova vrsta ločevalne tehnologije večdimenzionalna tekočinska kromatografija nima omejitev relativne molekulske mase in izoelektrične točke. S kombinacijo različnih načinov odpravlja diskriminatorni učinek dvodimenzionalne gelne elektroforeze. Ima značilnosti visoke maksimalne zmogljivosti in enostavne avtomatizacije. Dvodimenzionalna kromatografija z reverzno fazno izmenjavo ionov (2D-IEC-RPLC) je najpogosteje uporabljen večdimenzionalni sistem ločevanja s tekočinsko kromatografijo pri raziskavah proteomike.